DeepMind推出AlphaFold，可通過氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

　　PingWest 品玩 12 月 4 日訊，根據(jù)英國衛(wèi)報報道，周日在墨西哥坎昆舉辦的一場國際會議中，DeepMind 的最新 AI——AlphaFold 成功地根據(jù)基因序列預(yù)測出蛋白質(zhì)的 3D 形狀。

　　“蛋白質(zhì)折疊”是一種分子折疊形式。生物由蛋白質(zhì)構(gòu)成，生物體功能由蛋白質(zhì)形狀決定。理解蛋白質(zhì)的折疊方式可以幫助研究人員更好的了解蛋白質(zhì)本身的功能。

　　DeepMind 為預(yù)測“蛋白質(zhì)折疊”開發(fā)了 AlphaFold，并以該項目參加了 Critical Assessment of Structure Prediction (CASP)。CASP 是一年兩次的蛋白質(zhì)折疊奧運會，吸引了來自世界各地的研究小組。比賽的目的是根據(jù)氨基酸列表來預(yù)測蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，這些氨基酸列表會在幾個月內(nèi)每隔幾天發(fā)送給參賽團隊。這些蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)最近已經(jīng)通過傳統(tǒng)方法破解，作為比賽的正確答案。

　　盡管是首次參加比賽，AlphaFold 就在 98 名參賽者中名列榜首，準確地從 43 種蛋白質(zhì)中預(yù)測出了 25 種蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。而同組比賽中獲得第二名的參賽者僅準確預(yù)測出了 3 種。值得一提的是，AlphaFold 關(guān)注從零開始建模目標形狀，并不使用先前已經(jīng)解析的蛋白質(zhì)作為模板。AlphaFold 在預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的物理性質(zhì)上達到了高度的準確性，然后基于這些預(yù)測可以使用兩種不同的方法預(yù)測構(gòu)建完整的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
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